מספר גדול של bifidobacteria חי במעיים של אנשים בריאים. הנציג האופייני ביותר הוא תינוקות שאוכלים חלב אם . 99% מצומח חיידקי המעי שלהם הם bifidobacteria. מכיוון ש- bifidobacteria יכול לייצר חומצה אצטית וחומצה לקטית, ערך ה- pH במעי נוטה להיות חומצי חזק, כך שהוא יכול לעכב את צמיחת החיידקים הפתוגניים ולמנוע נגוע בגוף האדם.
זו הסיבה שלתינוקות ששותים חלב אם יש פחות שלשול או דלקת אטיטיס מאשר אלו ששותים חלב, וגם שיעור התמותה נמוך יותר. כמובן שזה נכון לא רק לתינוקות, אלא גם לתינוקות ומבוגרים. ככל שביפידובקטריה יותר שולטת במעיים, כך סביר להניח כי הוא יפלוש על ידי פתוגנים ומחלות הדבק.